In seiner Arbeitssitzung im Mai 2000 betonte der Koordinierungsrat erneut, dass es notwendig sei, die Aktivitäten in den deutsch-tschechischen Beziehungen auf die Zukunft zu konzentrieren, auch wenn man die Vergangenheit nicht einfach übergehen könne. In diesem Sinne entschied er, Arbeitsgruppen zu bilden, die sich ausdrücklich auf die derzeitige und künftige Entwicklung konzentrieren würden. Seitdem wurden von den verschiedenen Arbeitsgruppen regelmäßig Projekte vorgelegt, die sich je nach Ihrem Charakter fortgesetzt werden konnten.